По форме фисгармония напоминает пианино уменьшенных размеров. Клавиатура — органного (фортепианного) типа. Внутренняя голосовая часть фисгармонии делится на две половины; поэтому и клавиатура как бы разделяется пополам: диапазон левой части — от до большой октавы до ми первой, диапазон правой — от фа первой октавы до до четвертой.

Обычно фисгармония располагает четырьмя наборами голосовых планок с проскакивающими язычками. Эти наборы разделяются на левый и правый полунабор. Они включаются и выключаются с помощью выдвижных рычагов-переключателей; расположенные слева действуют на левый полунабор, расположенные справа — на правый. Количество регистров-переключателей встречается самое различное: от двух до тридцати. Голоса фисгармонии (по аналогии с органом) называются 16', 8', 4'. Голоса шестнадцатифутового регистра (левые — «бурдон», правые — «кларнет») звучат на октаву ниже написанного. Две пары голосов восьмифутового регистра (левые — «фагот — гобой», правые — «английский рожок — флейта») звучат и пишутся в октавах их звучания. Голоса четырехфутового регистра (левые — «рожок», правые — «свистулька») звучат октавой выше написанного. Из всего этого следует, что пятиоктавная клавиатура фисгармонии может дать в действительности звуки в диапазоне семи октав (до контроктавы — до пятой октавы). Комбинируя наборы этих регистров, можно получать разнообразные тембровые окраски.

Фисгармонии существуют во многих разновидностях: одни обладают приятным, нежным звуком — звук других может быть резким и крикливым, но во всех случаях характерным является довольно монотонное, спокойное звучание. На фисгармонии хорошо звучит сопровождение в выдержанных гармониях, певучие мелодии, спокойно-сосредоточенная музыка. В небольших оркестрах этот инструмент обычно выполняет функции отсутствующих духовых инструментов или используется для исполнения гармонической основы произведения; используется также в репетициях с хорами и домашнем музицировании.

Внутреннее устройство фисгармоний несмотря на их различные конструкции принципиально одинаково. Фисгармония состоит из следующих основных частей: педалей, мехов, подающих воздух или отсасывающих его, амортизационного меха-камеры, выравнивающего подачу воздуха и делающего ее равномерной, ряда (или рядов) голосовых планок и воздушных каналов к ним, клапанов, клавиатуры (регистры и створки). Расположение этих деталей может быть несколько различным в зависимости от конструкции и размеров. Различие может быть еще и в способе подачи воздуха: нагнетание мехами (венская система) или всасывание его (американская система). Названия эти утвердились по местам большего распространения, хотя обе системы возникли в Европе.

В стационарных фисгармониях можно встретить и разного рода дополнительные приспособления: устройство к амортизаци онному меху, позволяющее осуществлять crescendo и diminuendo. Для более тонкого исполнения динамических оттенков стали применять системы створок (открывающихся и закрывающихся с помощью регистров, расположенных над клавиатурой) и рычагов, управляемых коленями исполнителя. Иногда можно встретить приспособления, (позволяющие задерживать звук после снятия пальца с клавиши; еще реже встречается механика (наподобие фортепианной), приводящая в действие крохотный молоточек, ударяющий по голосу в момент открывания клапана (для большей четкости возникновения звука).

Фисгармонии производились не только в европейских странах, но и в странах Востока (например, Китае, Японии). В России тоже было несколько небольших фабрик и мастерских в Петербурге, Киеве, Москве, Бологом, производивших новые и ремонтировавших старые фисгармонии. Любопытно отметить, что на фисгармонной фабрике Д. А. Митропольского (Бологое), кроме обычных, производились серийно маленькие ручные фисгармонии — митрофоны, предназначавшиеся для работы с хором, а также оригинальные экспериментальные модели.